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MagicPrep《Nature》高分文章——美国急性重症肝炎患儿的腺相关病毒2型(AAV2)研究
人阅读 发布时间:2023-12-04 13:48
Chiu实验室 | 加州大学旧金山分校
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Chiu实验室从事传染病诊断和病原体研究的临床NGS检测方法的开发。
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在CLIA认证的实验室中临床验证用于传染病诊断的宏基因组NGS (mNGS)检测方案。
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研究病毒模型以了解其对人类宿主反应与疾病的影响。
研究材料与方法
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16例患者(27份样本——21份全血、2份血浆、1份肝组织、1份鼻咽拭子和2份粪便样本)
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来自45名儿童对照的全血样本
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样本检测方法有PCR法、宏基因组测序和靶向测序法
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Magicprep NGS系统用于DNA和RNA宏基因组学的文库制备,也用于HAdV-41和AAV病毒的靶向测序
研究结论
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研究表明,AAV2病毒和一种或多种肝致病性病毒的共同感染与严重急性肝炎的临床表现存在关联,尽管尚未确认直接的因果关系。
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AAV2感染可能对肝炎的发病机制和/或严重程度有所贡献,也可能是肝炎炎症的非致病性标志物。探讨该菌株或AAV2感染在该疾病中可能发挥的潜在因果作用还需要进一步的研究。
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作者推测,由于新冠疫情的孤立,年幼儿童未能获得广泛的免疫力,这可能是多种病毒感染病例增加的原因。
MagicPrep NGS系统为用户减少了手动NGS文库制备的时间和负担。