NGS是研究DNA结构和功能的重要工具，用途广泛。但是在使用这种技术时，特别是在处理降解或微量RNA时，通常都会遇到一些挑战。这些问题促使日本Kazusa DNA研究所的研究人员寻找合适的文库制备试剂盒，以便在处理低质量样本时为客户提供高质量的测序数据。

位于日本千叶县基萨拉苏的Kazusa DNA研究所(KDRI)成立于1994年，是世界上第一个专门从事DNA相关研究的机构。从那时起，该研究所参与了许多人类和植物基因组计划，并被公认为遗传研究的带头人之一。它对来自不同行业的客户提供的人类、植物和细菌样本进行NGS测序，包括农业—遗传分析对于培育具有所需性状和商业价值的重要植物物种以及使植物种子的质量标准化至关重要——以及医药，KDRI在医药领域应用NGS以支持罕见疾病的早期发现和新的癌症标记物和前体的鉴定。

 

客户案例

    

我们选择尝试Revelo试剂盒，因为它是专门为制备高度降解的样本而准备的。而那些只含有微量RNA的样本……Revelo系统似乎是我们的完美解决方案……

KDRI评估了Revelo™ RNA- seq高灵敏度文库制备试剂盒在NGS测序前处理低输入和降解或微量RNA样本的能力。这种灵活的端到端文库制备解决方案使用了Tecan专有的SPIABoost™技术，可为250 pg到10 ng的总RNA制备高质量文库。KDRI基因测序分析实验室的研究员Kazuto Kugou博士解释了该中心做出这一决定的原因：“我们选择尝试Revelo试剂盒，因为它是专门为制备高度降解的样本而设计的，例如，RNA RIN值（完整性）仅为1.8的样本，以及那些只含有微量RNA的样本。我们经常遇到这些类型的样本，并且通常是低通量的应用，因此Revelo系统似乎是我们的完美解决方案，我们热衷于尝试它。”

 

Kugou博士描述了Revelo试剂盒相对于他们早期在实验室测试过的其他选择的一些优势：“其他公司提供的文库制备工具都需要额外的DNA纯化步骤，以去除接头二聚体。相比之下，Revelo试剂盒包括DNase处理，这一个简单的步骤足以完全去除所有接头二聚体。因此，Revelo RNA-Seq让我们能够在短时间内使用几个PCR循环制备足量的纯化文库，减少PCR偏差，提供均一的5’到3’转录覆盖率。”

 

该实验室的部分职责是对RNA-Seq文库进行测序，并将测序数据映射到人类参考基因组序列上。在过去使用低质量的样本时，基因组映射非常困难，但该团队注意到，在使用Revelo试剂盒期间获得了足够的分析数据。Kugou博士说：“我们一直担心从高度降解或微量RNA的样本中获得的映射率，但当我们使用Revelo系统制备文库后，我们发现独特的映射率超过80%。”

 

Kugou博士总结道：“我们研究所的目标是在DNA研究的各个方面成为佼佼者，我们努力通过医学、农业、工业和教育为社会做出贡献。我们很高兴看到公司在未来几年开发出新的突破性解决方案，进一步推动基因分析领域的发展。”

 

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帝肯方案

  

*仅限科研使用，不用于临床诊断

 

有关Revelo RNA-Seq高灵敏度文库制备试剂盒的更多信息，请访问：

lifesciences.tecan.com/revelo-rna-seq-high-sensitivity

有关Kazusa DNA研究所的更多信息，请访问：

www.kazusa.or.jp/en