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与时俱进的生物样本库自动化方案
人阅读 发布时间:2016-10-20 14:20
海德尔堡心脏病生物样本库作为海德尔堡大学附属医院的一部分,每年收集几千份病人样本进行低温储存,并将其用于国家和欧洲医药研究项目。在从主病院区搬到新的设施中后,生物样本库采用了自动化流程以提高产量、质量和样品处理的一致性,这有助于推进整个欧洲的心脏病学研究进程。
“海德尔堡生物样本库团队——产量和质量都有显著提升,这是出乎意料而又非常受欢迎的好处。”
在过去二十年内,生物样本库在医药研究中扮演着越来越突出的角色。随着我们对许多疾病了解的增加,特种疾病生物储备越来越多的建议,以作为一般人群生物样本库的补充.
德国海德尔堡大学附属医院的心脏病学样本库就是此类设施之一。作为欧洲最大的医药部门,它完美的位置方便招募参与者进行临床研究查。Tanja Weis医生是海德尔堡心脏病学生物样本库主管,他说:“我们的主要焦点是收集和准备高质量的生物样本,样本主要来自于患有心肌疾病的病人,这些样本被低温保存,直到需要进行临床或分子研究时才取用。我们也是许多大规模项目和国际联盟的核心生物样本库,包括欧洲FP7“Best Ageing”联合会、欧洲地平线2020年NISCI联合会和德国心血管研究中心的TORCH(心肌症平移登记)。另外,我们与全球生物银行就收集技术、样品和质量管理、SOPS开发和分析过程进行合作。”
对基因组学和个体化用药的不断关注,海德尔堡心脏病学生物样本库现在每年负责准备和储存超过10万份病人样品,很大一部分需要进行样品分装和核酸提取。工作量的增加促使日常样品处理有手工转为自动化。这显著提高了分装的速度,也提高了提取DNA的产量和质量。
TANJA继续说道:“生物样本库建立于8年前,当时只有一些-80摄氏度的冰箱和液氮罐,而后来增加到大约70个冰箱!样品处理工作花费了大量人力物力。自动化变成我们的必需。因此,当我们迁入特别建造的实验室时,我们采用了LICONIC STC低温储存系统Tecan Freedom EVO自动化工作站。
“Tecan自动化系统的实施非常顺利。我们在一周内使用实际样本对系统进行了验证,从那时起工作站便每天处于使用状态。以前DNA都采用手动提取。虽然可行,但是很费时间,并且在质量上都没有自动化方案有保证。技术人员通过Freedom EVO直观的触摸屏开启运行,按提示操作,几小时的学习就能掌握,且不容易犯错。自动化提高了提取速度,在很短的时间内就能收回成本。所提取的DNA产量和质量都有显著提升,这是出乎意料而又非常受欢迎的好处。”
“我们工作流程中的另一个瓶颈就是体液样品分装。手动操作时,速度很慢,重复的过程存在着潜在的人为错误,所以我们也投资了一台Tecan Freedom EVO150工作站。目前我们在平台上运行着20个独立的方案,包括血液、血清、血浆、尿液和脑脊液等的分离和分装。基于红外激光的血液分层探测模块TIU是一个巨大的优势,它能够精确识别血浆、白膜层和红细胞的界面,并引导自动吸液转移。我们也大量使用软件的3D模拟工具,这样就可以在开机前发现任何潜在的问题。”
Tanja总结道:“选择Tecan工作站的原因有很多,包括质量、性能、可靠性、耐用性和坚固性等等。系统的灵活性适应我们随时变化需求,并能与新的LIMS系统兼容,这点是至关重要的。我相信这套系统将会支持我很多年,这将是无法用价格来衡量的。”
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www.heldelberg-cardiobiobank.com
*只供研究用,不可用于临床诊断。